Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx1P83917 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cbx1P83917 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms