Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx1P80205 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otx1P80205 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx1P80205 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms