Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh9P70407 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh9P70407 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms