Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprvP70289 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprvP70289 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprvP70289 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprvP70289 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprvP70289 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprvP70289 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprvP70289 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprvP70289 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprvP70289 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprvP70289 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprvP70289 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprvP70289 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms