Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Abcc9P70170 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Abcc9P70170 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
Abcc9P70170 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC44.63■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Abcc9P70170 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc9P70170 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.2 ms