Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Barhl1P63157 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Barhl1P63157 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms