Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpcal1P62748 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpcal1P62748 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpcal1P62748 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms