Protein–RNA interactions for Protein: P62242

Rps8, 40S ribosomal protein S8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps8P62242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps8P62242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps8P62242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps8P62242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps8P62242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps8P62242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps8P62242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps8P62242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps8P62242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps8P62242 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps8P62242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps8P62242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps8P62242 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps8P62242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms