Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd6P61407 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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