Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2fP61219 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2fP61219 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2fP61219 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms