Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf1P61148 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms