Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snap25P60879 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap25P60879 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap25P60879 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap25P60879 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap25P60879 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms