Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2aP59997 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm2aP59997 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kdm2aP59997 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm2aP59997 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm2aP59997 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kdm2aP59997 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm2aP59997 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm2aP59997 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms