Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rhbdl3P58873 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdl3P58873 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdl3P58873 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdl3P58873 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rhbdl3P58873 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rhbdl3P58873 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms