Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp3P58854 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp3P58854 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms