Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp5P56399 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp5P56399 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp5P56399 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms