Protein–RNA interactions for Protein: P56392

Cox7a1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7a1P56392 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7a1P56392 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7a1P56392 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox7a1P56392 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms