Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NrlP54846 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NrlP54846 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NrlP54846 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NrlP54846 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NrlP54846 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NrlP54846 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NrlP54846 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NrlP54846 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NrlP54846 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NrlP54846 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NrlP54846 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NrlP54846 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NrlP54846 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NrlP54846 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NrlP54846 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NrlP54846 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NrlP54846 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NrlP54846 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NrlP54846 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NrlP54846 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NrlP54846 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NrlP54846 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NrlP54846 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NrlP54846 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NrlP54846 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrlP54846 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrlP54846 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrlP54846 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrlP54846 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NrlP54846 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NrlP54846 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms