Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmc4P54775 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc4P54775 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms