Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stmn1P54227 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms