Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Map3k1P53349 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Map3k1P53349 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Map3k1P53349 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Map3k1P53349 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms