Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp1P52624 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp1P52624 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp1P52624 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp1P52624 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp1P52624 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp1P52624 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp1P52624 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upp1P52624 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upp1P52624 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp1P52624 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp1P52624 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp1P52624 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp1P52624 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms