Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx3P50481 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx3P50481 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx3P50481 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms