Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp3P50462 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csrp3P50462 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms