Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl13P47963 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl13P47963 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms