Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd4P46935 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd4P46935 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nedd4P46935 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms