Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-5P42582 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-5P42582 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms