Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpl28P41105 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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