Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fen1P39749 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fen1P39749 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fen1P39749 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fen1P39749 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fen1P39749 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fen1P39749 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fen1P39749 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fen1P39749 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fen1P39749 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fen1P39749 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fen1P39749 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fen1P39749 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fen1P39749 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fen1P39749 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fen1P39749 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fen1P39749 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fen1P39749 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fen1P39749 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fen1P39749 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms