Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprkP35822 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprkP35822 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprkP35822 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PtprkP35822 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprkP35822 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprkP35822 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprkP35822 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprkP35822 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprkP35822 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprkP35822 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprkP35822 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprkP35822 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprkP35822 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprkP35822 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprkP35822 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms