Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SsbP32067 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SsbP32067 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SsbP32067 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SsbP32067 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SsbP32067 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SsbP32067 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SsbP32067 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SsbP32067 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SsbP32067 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SsbP32067 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SsbP32067 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SsbP32067 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SsbP32067 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SsbP32067 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SsbP32067 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SsbP32067 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SsbP32067 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SsbP32067 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SsbP32067 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SsbP32067 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SsbP32067 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SsbP32067 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SsbP32067 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SsbP32067 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SsbP32067 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SsbP32067 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SsbP32067 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SsbP32067 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SsbP32067 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SsbP32067 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SsbP32067 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SsbP32067 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SsbP32067 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SsbP32067 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SsbP32067 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SsbP32067 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SsbP32067 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SsbP32067 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SsbP32067 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SsbP32067 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SsbP32067 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SsbP32067 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SsbP32067 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SsbP32067 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms