Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp1P29452 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp1P29452 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casp1P29452 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp1P29452 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp1P29452 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp1P29452 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp1P29452 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp1P29452 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp1P29452 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp1P29452 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms