Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IppP28575 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IppP28575 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IppP28575 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IppP28575 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IppP28575 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IppP28575 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IppP28575 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IppP28575 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IppP28575 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IppP28575 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IppP28575 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IppP28575 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IppP28575 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IppP28575 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IppP28575 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IppP28575 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IppP28575 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IppP28575 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IppP28575 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IppP28575 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IppP28575 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IppP28575 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IppP28575 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IppP28575 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IppP28575 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IppP28575 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IppP28575 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IppP28575 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IppP28575 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IppP28575 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IppP28575 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IppP28575 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IppP28575 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IppP28575 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IppP28575 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IppP28575 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IppP28575 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IppP28575 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IppP28575 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IppP28575 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IppP28575 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IppP28575 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IppP28575 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IppP28575 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms