Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk11bP24788 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk11bP24788 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk11bP24788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms