Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChrneP20782 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChrneP20782 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChrneP20782 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChrneP20782 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChrneP20782 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChrneP20782 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms