Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prim1P20664 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prim1P20664 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prim1P20664 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prim1P20664 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prim1P20664 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prim1P20664 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prim1P20664 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prim1P20664 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prim1P20664 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prim1P20664 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prim1P20664 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Prim1P20664 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prim1P20664 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prim1P20664 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prim1P20664 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prim1P20664 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prim1P20664 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms