Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnat1P20612 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnat1P20612 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnat1P20612 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnat1P20612 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms