Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fcer1aP20489 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcer1aP20489 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms