Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd1P19182 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd1P19182 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd1P19182 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms