Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl9P18340 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl9P18340 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcl9P18340 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms