Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tph1P17532 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tph1P17532 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tph1P17532 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tph1P17532 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tph1P17532 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tph1P17532 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tph1P17532 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms