Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmga1P17095 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmga1P17095 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms