Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhoP15409 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhoP15409 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhoP15409 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhoP15409 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhoP15409 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhoP15409 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhoP15409 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhoP15409 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhoP15409 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhoP15409 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhoP15409 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RhoP15409 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RhoP15409 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RhoP15409 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RhoP15409 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhoP15409 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RhoP15409 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhoP15409 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhoP15409 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhoP15409 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhoP15409 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhoP15409 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhoP15409 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhoP15409 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhoP15409 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RhoP15409 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RhoP15409 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RhoP15409 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RhoP15409 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhoP15409 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhoP15409 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhoP15409 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RhoP15409 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RhoP15409 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RhoP15409 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RhoP15409 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RhoP15409 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RhoP15409 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RhoP15409 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhoP15409 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RhoP15409 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhoP15409 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhoP15409 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhoP15409 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhoP15409 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhoP15409 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhoP15409 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhoP15409 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhoP15409 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhoP15409 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhoP15409 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhoP15409 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhoP15409 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhoP15409 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms