Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Dnmt1P13864 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Dnmt1P13864 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Dnmt1P13864 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Dnmt1P13864 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Dnmt1P13864 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms