Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd5P13379 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd5P13379 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd5P13379 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms