Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2bP12400 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctla2bP12400 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2bP12400 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms