Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01739 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01739 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01739 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01739 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01739 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01739 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01739 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01739 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01739 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01739 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01739 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01739 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01739 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01739 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01739 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01739 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms