Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01663 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01663 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01663 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01663 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01663 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01663 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01663 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01663 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01663 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01663 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01663 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01663 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01663 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01663 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01663 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01663 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01663 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01663 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01663 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01663 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01663 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
P01663 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01663 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01663 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01663 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01663 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01663 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01663 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms