Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01662 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01662 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01662 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01662 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01662 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01662 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01662 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01662 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01662 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01662 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01662 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01662 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01662 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01662 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01662 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01662 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01662 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01662 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01662 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01662 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01662 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
P01662 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01662 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01662 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01662 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01662 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01662 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01662 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms