Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01638 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01638 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01638 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01638 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01638 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01638 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
P01638 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01638 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01638 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01638 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01638 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01638 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01638 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01638 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01638 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01638 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01638 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01638 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01638 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01638 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01638 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01638 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01638 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01638 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms